Che il collettore diventi incandescente con lo starter azionato è normale, specie se questo viene mantenuto a lungo.
Bisogna vedere se erano tuti e due incandescenti o uno solo, in questo caso c'è una differente carburazione tra i due cilindri, che spiegherebbe la difficoltà di avviamento a freddo.
Darei una controllata all'iniezione, per vedere se è bilanciata.